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女子スポーツの高まりから、女子高校生の野球競技参加の意識が高まったが、従来の高校野球部の統括組織である日本高等学校野球連盟規定では、危険防止の観点から男子部員と一緒に主催の野球大会に参加することは認められていません。

そんな中、1995年に北京市の女子硬式野球チームが来日して「日中親善高等学校女子硬式野球大会」が開催されたほか、翌1996年には韓国の女子硬式野球チームが来日して同様の大会が開催された。これを機に、日本でも高校レベルにおける女子硬式野球の全国大会を開催すべきとの気運が高まり、その開催母体となるべく1997年に結成されたのが全国高等学校女子硬式野球連盟です。

全国高等学校連合・丹波は高校にチームのない選手たちが集まり、全国高等学校女子硬式野球連盟の開催する試合、いわゆる「女子の甲子園」に公式参加することができます。